| 기관 | 상위 기관 | 소재지 | 설립 |
|---|---|---|---|
| 건축도시공간연구소 | — | 세종특별자치시 | 2020 |
| 과학영재교육연구원 | 한국과학기술원 | 대전광역시 | — |
| 국가녹색기술연구소 | — | 서울특별시 | 2011 |
| 국가데이터연구원 | 대한민국 국가데이터처 | 서구 | — |
| 국가수리과학연구소 | — | 유성구 | 2005 |
| 국립보건연구원 | 대한민국 질병관리청 | — | 1963 |
| 국민연금연구원 | 국민연금공단 | 전주시 | — |
| 국방과학연구소 | 방위사업청 | 대전광역시 | 1970 |
| 국토연구원 | — | 세종특별자치시 | 1978 |
| 극지연구소 | 대한민국 해양수산부 | 인천광역시 | 2004 |
| 기초과학연구원 | — | 대전광역시 | 2011 |
| 대외경제정책연구원 | — | 세종특별자치시 | 1990 |
| 러시아연구소 | 서울대학교 | — | 1989 |
| 산업연구원 | — | 세종특별자치시 | 1976 |
| 선박해양플랜트연구소 | 대한민국 해양수산부 | 대전광역시 | 2013 |
| 세종연구소 | — | 성남시 | 1986 |
| 소프트웨어정책연구소 | — | 경기도 | 2014 |
| 수원시정연구원 | — | 수원시 | 2013 |
| 육아정책연구소 | 한국보건사회연구원 | 서울특별시 | 2005 |
| 전력연구원 | 한국전력공사 | 대전광역시 | — |
| 정보통신정책연구원 | — | 충청북도 | 1988 |
| 제주평화연구원 | — | 서귀포시 | 2006 |
| 치안정책연구소 | 경찰대학 | — | 2005 |
| 통일연구원 | — | 서울특별시 | 1990 |
| 한국개발연구원 | — | 세종특별자치시 | 2005 |
| 한국과학기술정보연구원 | 국가과학기술연구회 | — | 1962 |
| 한국교통연구원 | 대한민국 국토교통부 | 세종특별자치시 | 1985 |
| 한국기계연구원 | 대한민국 미래창조과학부 | — | 1976 |
| 한국농촌경제연구원 | — | 나주시 | 1978 |
| 한국문화관광연구원 | 대한민국 문화체육관광부 | 서울특별시 | 1985 |
| 한국법제연구원 | — | 세종특별자치시 | 1990 |
| 한국보건사회연구원 | — | 세종특별자치시 | 1970 |
| 한국보건의료연구원 | 대한민국 보건복지부 | 서울특별시 | 2008 |
| 한국여성정책연구원 | 경제인문사회연구회 | 서울특별시 | 1983 |
| 한국예술연구소 | 한국예술종합학교 | — | 1993 |
| 한국전자기술연구원 | 산업통상자원부 | — | 1991 |
| 한국지식재산연구원 | 대한민국 특허청 | 서울특별시 | 2005 |
| 한국직업능력연구원 | — | 원주시 | 1997 |
| 한국청소년정책연구원 | — | 세종특별자치시 | 1989 |
| 한국학중앙연구원 | 대한민국 교육부 | — | 1978 |
| 한국행정연구원 | — | 서울특별시 | 1991 |
| 한국형사·법무정책연구원 | — | 서울특별시 | 1989 |
| 한국환경연구원 | — | 세종특별자치시 | 1992 |